Asam amino aromatik mampu menyerap cahaya karena ikatan rangkap terkonjugasinya. Karakteristik asam amino aromatik ini digunakan untuk mengukur konsentrasi protein dalam sampel yang tidak diketahui. Asam amino ini mampu menyerap cahaya yang merangsang elektronnya ke keadaan tereksitasi, ketika elektron jatuh kembali ke tanah, ia akan memancarkan cahaya atau melepaskan energi. jika molekul mampu memancarkan cahaya itu dikenal sebagai molekul fluorescent. triptofan banyak digunakan sebagai molekul fluoresen.
Asam amino aromatik, seperti triptofan (Trp), fenilalanin (Phe), dan tirosin (Tyr), terbentuk dari E4P di jalur PP dan PEP di glikolisis. Reaksi pertama dari sintesis ini dikatalisis oleh deoxyalabino hepturose phosphate synthase (DAHPS), di mana ini adalah enzim pengatur yang penting.
Kemudian asam shikimic (Shik) terbentuk setelah empat langkah dari reaksi pertama, dan asam chorismic (CM) terbentuk setelah tujuh langkah reaksi dari reaksi pertama. Dari chorismate, asam antranil dibentuk oleh asam antranil sintase, dan Trp terbentuk setelah beberapa langkah reaksi dari ini. Namun, asam prephenic (PA) dibentuk dari CM oleh mutase asam corismic, dan kemudian Trp dibentuk dari PA oleh dehidrogenase asam prephenic dan transaminase tyrosine. Fenilalanin terbentuk dari PA oleh dehidrogenase asam pratenat dan transaminase tirosin